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琼脂糖凝胶浓度怎么选:分离范围对照

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琼脂糖凝胶由加热溶解后冷却的琼脂糖形成三维网状结构,孔径大小由浓度决定。核酸分子带负电,在电场中向正极迁移,片段越小越容易被网孔筛过、跑得越快,这就是分子筛效应。

一、浓度与可分离片段范围的对照

  • 1、0.6%:适合 5–20 kb 的大片段,孔径大、大分子也能挤过去。
  • 2、1.0%:适合 1–10 kb 的常规片段,是 PCR 产物和质粒检测的通用浓度。
  • 3、1.2%:适合 0.5–6 kb 的中短片段,分辨力比 1.0% 更细。
  • 4、1.5%–2.0%:适合 0.1–0.5 kb 的小片段,孔径小,短片段之间也能分开。

二、配胶与选浓度的几个要点

  • 1、浓度按预期片段大小反过来定:片段越大浓度越低,片段越小浓度越高。
  • 2、加热溶解要彻底。琼脂糖完全溶解后溶液应清澈无颗粒,局部未溶的颗粒会让条带背景变脏。
  • 3、加核酸染料的时机有讲究:待胶液冷却到约 55–60 ℃再加入并混匀,温度过高会让染料分解,过低则胶液已经开始凝固。
  • 4、凝胶浓度也与电压配合。高浓度胶电阻大,电压应相应压低,否则发热加剧、条带变形。
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